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| 基因电脑克隆和基因组多态性数据库 中科院生物物理所生物信息学研究组自1985年以来一直从事生物分子的电子结构、蛋白质的构象与功能、基因组DNA序列信息分析等方面的研究工作。近几年来,研究组主要在基因组测序和信息标注、基因组非编码区的信息分析、比较基因组学、系统生物学等方面开展研究工作,在理论模型的提出和算法设计方面都取得了一些成果。基因电脑克隆部分包括六个子数据库:EST 序列数据库, 数据量20G;电脑克隆新基因候选序列库, 数据量30G;冠心病高血压相关SNP数据库, 数据量50G; 猪SNP数据库, 数据量15G; 人mRNA可变剪接数据库, 数据量120G; 猪mRNA可变剪接数据库, 数据量30G。包括纯化后的EST序列(由对dbEST数据库进行去载体及其它污染序列而得)数据库,和以这些EST序列为基础,利用我们自己的软件包SiClone进行大规模计算而获得的新基因候选序列数据库。基因组多态性数据包括SNP和可变剪接位点数据两部分,前者既包括国际公共数据库里的数据,也有我们自己的数据,后者主要通过对EST序列和基因组序列的大规模分析而获得。 |
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